A Direcção Científica é o órgão dos Serviços Centrais responsável pela coordenação, execução, supervisão de políticas institucionais relativas à investigação científica, extensão e Pós-graduação. A Direcção Científica é dirigida por um Director dos Serviços Centrais.
Compete à Direcção Científica, propor/disseminar e monitorar a política de investigação científica e de extensão da Universidade; Propor/implementar e monitorar normas relacionadas a actividades científicas de extensão e pós-graduação; Monitorar as actividades de investigação e extensão realizadas nas Unidades Orgânicas; Implementar o plano institucional de formação e desenvolvimento do corpo docente e investigador, no contexto da pós-graduação; Divulgar oportunidades de financiamento à Investigação, Extensão e de Pós-graduação; Sistematizar dados inerentes a actividade de pesquisa e pós-graduação da Universidade; Coordenar a definição das linhas de pesquisa científicas da Universidade;
Além dessas atribuições, cabe também à direcção Cientifica, emitir pareceres sobre cursos e programas de Pós-graduação; Organizar eventos científicos da Universidade e monitorar os realizados pelas Unidades Orgânicas; Supervisionar projectos científicos realizados na Universidade; Exercer outras actividades decorrentes da lei e das orientações dos órgãos de Direcção Superior da Universidade.
A Direcção Científica compreende, na sua estrutura, os Departamentos de Investigação e Projectos; Departamento de Pós-Graduação, Carreira Docente e de Investigador; e Departamento de Extensão e Inovação, ainda, a Repartição de Administração Interna.